CECAD

Lipidomics/Metabolomics Facility

Seit mehr als 10 Jahren bietet die Facility einen umfassenden Service für die Analyse von Lipiden in biologischen Proben mit modernsten chromatographischen und massenspektrometrischen (MS) Techniken. Seit Anfang 2019 haben wir unsere Expertise auf die Analyse von polaren und ionischen Metaboliten erweitert. Unser Service umfasst den gesamten Workflow von der Probenvorbereitung über die MS-Messung der relevanten Metaboliten bis hin zur Prozessierung und Analyse der gewonnenen Rohdaten. Seit 2016 ist die CECAD Lipidomics/Metabolomics Facility im DFG-Portal "RIsources", einem Portal für Forschungsinfrastrukturen, registriert.

 

Dr. Susanne Brodesser, Dipl. Chem.
Head of the Lipidomics/Metabolomics Facility 
 +49 221 478 840 15
susanne.brodesser[at]uk-koeln.de

CECAD Lipidomics/Metabolomics Facility
CECAD Research Center
University of Cologne
Joseph-Stelzmann-Str. 26
50931 Köln
Profile

Figures

Figure 1
LC/MS/MS separation of sphingolipids from mouse liver: This approach includes the pre-separation of the lipid extract via a LC system. Lipids are detected at the QTRAP 6500 by Multiple Reaction Monitoring (MRM). Each peak represents a ceramide, glucosylceramide or sphingomyelin species acylated by a distinct fatty acid.

Figure 2
Shotgun Lipidomics analysis of glycerophospholipid subclasses (GPLs) from keratinocyte mitochondria (mitochondria provided by Rudolf Wiesner, Department of Physiology, Cologne). GPLs were simultaneously detected by applying specific precursor ion and neutral loss scans for each subclass (Multiple Precursor Ion Scanning, MPIS). Each peak in the mass spectrum represents a GPL species with a distinct fatty acid composition.

Preise

Für unsere Routineanalysen erheben wir Gebühren. Die Gebühren sind nach Nutzergruppen gestaffelt (CECAD Mitglieder, Angehörige der Universität zu Köln, externe Wissenschaftler). Wenden Sie sich bei Preisanfragen bitte an Dr. Susanne Brodesser.

Ausgewählte Publikationen
  • Yu H, Dilbaz S, Coßmann J, Hoang AC, Diedrich V, Herwig A, Harauma A, Hoshi Y, Moriguchi T, Landgraf K, Körner A, Lucas C, Brodesser S, Balogh L, Thuróczy J, Karemore G, Kuefner MS, Park EA, Rapp C, Travers JB, Röszer T. (2019) Breast milk alkylglycerols sustain beige adipocytes through adipose tissue macrophages. J Clin Invest 130:2485-99
  • Turpin-Nolan SM, Hammerschmidt P, Chen W, Jais A, Timper K, Awazawa M, Brodesser S, Brüning JC. (2019) CerS1-Derived C18:0 Ceramide in Skeletal Muscle Promotes Obesity-Induced Insulin Resistance. Cell Rep 26(1):1-10
  • Späth MR, Bartram MP, Palacio-Escat N, Hoyer KJR, Debes C, Demir F, Schroeter CB, Mandel AM, Grundmann F, Ciarimboli G, Beyer A, Kizhakkedathu JN, Brodesser S, Göbel H, Becker JU, Benzing T, Schermer B, Höhne M, Burst V, Saez-Rodriguez J, Huesgen PF, Müller RU, Rinschen MM. (2019) The proteome microenvironment determines the protective effect of preconditioning in cisplatin-induced acute kidney injury. Kidney Int 95(2):333-49
  • Rashid T, Nemazanyy I, Paolini C, Tatsuta T, Crespin P, de Villeneuve D, Brodesser S, Benit P, Rustin P, Baraibar MA, Agbulut O, Olivier A, Protasi F, Langer T, Chrast R, de Lonlay P, de Foucauld H, Blaauw B, Pende M. (2019) Lipin1 deficiency causes sarcoplasmic reticulum stress and chaperone-responsive myopathy. EMBO J 38(1):e99576
  • Edifizi D, Nolte H, Babu V, Castells-Roca L, Mueller MM, Brodesser S, Krüger M, Schumacher B. (2017) Multilayered Reprogramming in Response to Persistent DNA Damage in C. elegans. Cell Rep 20(9):2026-43